Ny norskutviklet hurtigtest til påvisning av bakterier

Metoden er beskrevet i en artikkel i Nature Communications¹ og er også omtalt på NRK.no².

Forfatterne skriver i sin introduksjon at urinveisinfeksjoner (UVI) er de nest mest utbredte infeksjonene på verdensbasis, og rammer 405 millioner mennesker årlig og forårsaker ubehag og kan medføre alvorlig sykdom. I løpet av de siste tre tiårene har globale dødsfall på grunn av UVI økt dramatisk med 140 prosent³. Ubehandlede urinveisinfeksjoner kan utvikle seg til pyelonefritt og urosepsis, som utgjør omtrent en fjerdedel av alle sepsistilfeller⁴. Kateterassosierte urinveisinfeksjoner utgjør 75–95 prosent av sykehuservervede urinveisinfeksjoner⁵. Hvis infeksjonen ikke behandles umiddelbart, er en sekundær blodinfeksjon, spesielt blant kateterassosierte UVI, kjent for å øke dødeligheten til 30 prosent, noe som utgjør en betydelig risiko⁶.

Ved alvorlige urinveisinfeksjoner er det avgjørende å administrere effektive antibiotika så snart som mulig. Dagens diagnostiske metode er bakteriedyrkning og resistensbestemmelse, som tar 2 til 4 dager. I påvente av prøvesvaret må pasienter behandles med bredspektrede antibiotika - noe som fører til økt risiko for utvikling av antibiotikaresistens.

Den nye metoden beskrives som en dyrkningsfri metagenomisk neste generasjons sekvensering (mNGS) med bruk av nanopore-sekvensering. Det gjør det mulig å identifisere hele metagenomet (i både mono- og polymikrobielle UVI-er)⁷ og kjente resistensmekanismer i en klinisk prøve⁸. Det revolusjonerende er at disse svarene foreligger i løpet av 3-4 timer, noe som dramatisk endrer mulighetene for optimal behandling på et tidlig tidspunkt.

Artikkelen beskriver en studie med 78 pasienter med komplisert UVI der forfatterne sammenlignet tradisjonell dyrkning og resistensbestemmelse med den nye metoden. De fant at metoden har en nøyaktighet på 99 prosent for bakteriepåvisning og 90 prosent sensitivitet for antibiotikafølsomhet og med en spesifisitet på 95 prosent.

Oppsummert skriver forfatterne at metoden gir en vesentlig raskere diagnose av kliniske UVI ved bruk av en kostnadseffektiv og skalerbar metode som krever rundt fire timer fra prøveinnsamling til informert beslutningstaking. Videre reduserer metoden dagens empiriske behandling og sikrer en mer fornuftig bruk av antibiotika.

Forskermiljøet ved Universitetet i Innlandet berømmes for sitt arbeide. Foreløpig krever testen uforholdsmessig mye laboratoriemessig håndarbeid. For at metoden skal kunne tas i bruk rutinemessig, må analysene automatiseres. Det arbeides det med, og det estimeres at det vil ta to til fem år².